Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpsf3Q9QXK7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms