Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc5Q9QX29 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms