Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rai2Q9QVY8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms