Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms