Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc42ep4Q9JM96 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms