Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crlf1Q9JM58 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Crlf1Q9JM58 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crlf1Q9JM58 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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