Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rabgef1Q9JM13 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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