Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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