Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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