Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn15Q9JLG8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms