Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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