Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms