Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hmgn5Q9JL35 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hmgn5Q9JL35 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hmgn5Q9JL35 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hmgn5Q9JL35 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hmgn5Q9JL35 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hmgn5Q9JL35 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hmgn5Q9JL35 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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