Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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