Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Efcc1Q9JJF6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Efcc1Q9JJF6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Efcc1Q9JJF6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Efcc1Q9JJF6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Efcc1Q9JJF6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Efcc1Q9JJF6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efcc1Q9JJF6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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