Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms