Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc12a4Q9JIS8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms