Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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Rb1cc1Q9ESK9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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Rb1cc1Q9ESK9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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Rb1cc1Q9ESK9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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Rb1cc1Q9ESK9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rb1cc1Q9ESK9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
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