Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms