Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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