Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms