Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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