Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms