Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnft1Q9DCN7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms