Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmg20aQ9DC33 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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