Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Csnk1dQ9DC28 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Csnk1dQ9DC28 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Csnk1dQ9DC28 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Csnk1dQ9DC28 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Csnk1dQ9DC28 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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