Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ccdc97Q9DBT3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ccdc97Q9DBT3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ccdc97Q9DBT3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ccdc97Q9DBT3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ccdc97Q9DBT3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ccdc97Q9DBT3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ccdc97Q9DBT3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc97Q9DBT3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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