Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB60

Fam213b, Prostamide/prostaglandin F synthase, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam213bQ9DB60 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam213bQ9DB60 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms