Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc89Q9DA73 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms