Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms