Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp12Q9D9M2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp12Q9D9M2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp12Q9D9M2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp12Q9D9M2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp12Q9D9M2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp12Q9D9M2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms