Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms