Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo2Q9D8S4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms