Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms