Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc91Q9D8L5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc91Q9D8L5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms