Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8L0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D8L0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms