Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Derl3Q9D8K3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms