Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms