Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2c55Q9D816 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms