Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nop56Q9D6Z1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nop56Q9D6Z1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Nop56Q9D6Z1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Nop56Q9D6Z1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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