Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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