Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms