Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cmtm5Q9D6G9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm5Q9D6G9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms