Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PudpQ9D5U5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PudpQ9D5U5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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