Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D5Q8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms