Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lonrf3Q9D4H7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms