Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp2bpQ9D4C6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms