Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms