Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc6bQ9D289 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Trappc6bQ9D289 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc6bQ9D289 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc6bQ9D289 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms