Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q6

Erp44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp44Q9D1Q6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp44Q9D1Q6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms